Các chuyên gia cho rằng nuôi trồng thủy sản thực sự là cách duy nhất để đảm nguồn cung cho nhu cầu thủy sản bền vững. Chìa khóa là tìm ra một phương pháp bền vững để nuôi các loài cá. Theo Jacqueline Claudia, đồng sáng lập LoveTheWild, thành viên của Hội đồng Quản trị Viện Thủy sản Quốc gia, những quan niệm sai lầm truyền thống về sự không bền vững của cá nuôi được bắt đầu vào những năm 1970.
Cục Khai thác Thủy sản Na Uy đã cấp giấy phép phát triển cho hệ thống đóng kín hình trứng của Tập đoàn Marine Harvest.
Những hệ thống khép kín này được phát triển bởi Hauge Aqua (Công ty giải pháp công nghệ thủy sản của Na Uy), thiết kế để loại bỏ các loại vi khuẩn và ngăn ngừa các chất dạng hạt được thải ra môi trường biển. Mỗi cấu trúc 20.000 m3 có khả năng sản xuất đến 1.000 tấn cá hồi, mật độ thả khoảng 1,3 lần hiện đang được sử dụng trong lồng bút.
Để nâng cao chất lượng tôm giống, hiện nay các nhà khoa học và các doanh nghiệp chú trọng đến các lĩnh vực có liên quan đến quy trình sản xuất giống tôm.
Một số vấn đề quan trọng cần quan tâm như: Nghiên cứu gia hóa (thuần hóa, làm thay đổi mức độ di truyền tính trạng vật nuôi, tạo ra những tính trạng tốt nhất) tôm sú và tôm thẻ chân trắng; Nghiên cứu nhu cầu dinh dưỡng của tôm bố mẹ; Nghiên cứu nhu cầu dinh dưỡng và thức ăn cho giai đoạn ấu trùng và hậu ấu trùng; Quản lý chất lượng nước và phòng trị bệnh.
Tôm càng xanh là loài nuôi khá phổ biến ở nước ta bởi chúng thích nghi tốt với sự biến đổi của điều kiện môi trường. Nhưng những mầm bệnh như: Macrobrachium rosenbergii Taihu virus (MrTV), Macrobrachium nipponensis Reovirus (MNRV), Virus Macrobrachium rosenbergii Noda (MrNV), Macrobrachium hepatopancreatic parvolike virus (MHPV)… gây hại lớn trên tôm càng xanh cần phải biết và phòng tránh kịp thời.
Da cá hồi an toàn cho người ăn. Tuy nhiên, có rất nhiều yếu tố khách quan khác ảnh hưởng đến chất lượng của cá hồi khiến da của chúng không được đảm bảo. Cá hồi ngon và bổ dưỡng. Ngoài cung cấp một nguồn protein dồi dào, nó còn cung cấp axit béo, omega 3, vitanmin B và D, các khoáng chất như niacin và phốt pho. Nhiều người nghĩ rằng một miếng thịt đỏ có thể thay thế cho miếng cá hồi không da, nhưng một số người lại muốn ăn luôn miếng cá còn da để hấp thụ được hết các chất dinh dưỡng.
Hiện, ngoài tình trạng dịch bệnh và ô nhiễm môi trường thì vấn đề tìm nguồn thức ăn tự nhiên có nguồn gốc từ thực vật thay thế cho thức ăn công nghiệp được quan tâm. Mới đây, một nghiên cứu được tiến hành nhằm xác định khả năng thay thế thức ăn viên công nghiệp bằng khoai lang trong nuôi tôm thẻ chân trắng theo công nghệ biofloc.
Tại Chilê, phòng thí nghiệm dược phẩm của Centrovet đã phát triển một giải pháp mới dựa trên đất sét nhằm hạn chế sự nở hoa của các loài tảo gây hại (HABs) đang ảnh hưởng nghiêm trọng đến ngành nuôi trồng thuỷ sản. Quá trình này dựa trên việc sử dụng đất sét bột để làm chìm tảo vào đáy biển – một kỹ thuật được tạo ra để giữ hồ bơi đã được sử dụng trong Thế vận hội Bắc Kinh năm 2008